温州医学院是浙江省省属重点建设大学。学校可溯源至创办于1912年的浙江医学专门学校，1958年8月由浙江医学院从杭州分迁至温州建立，初名“浙江第二医学院”，后改用现名。

学校1958年开始招收五年制本科学生，是全国首批硕士学位授予单位，具有博士学位授予权。现有临床医学一级学科博士点；有临床医学、中药学、生物学、生物医学工程、基础医学、中西医结合、药学、护理学等8个一级学科硕士点。设有临床医学一级学科博士后科研流动站。拥有推荐优秀应届本科毕业生免试攻读硕士学位资格。现有1个省部共建国家重点实验室培育基地、10个省部级重点实验室（研究中心），1个省“重中之重一级学科”、2个省重中之重学科和10个省重点学科。

学校有31个本科专业和1个七年制本硕连读专业，涉及医学、理学、工学、管理学、文学、法学、教育学等七大学科门类。目前有全日制在校生15000余人（不含独立学院——温州医学院仁济学院），其中博士研究生87人，硕士研究生2400余人，学历教育留学生620余人。学校已形成从本科生到硕士生、博士生及博士后，从全日制到成人教育、留学生和港澳台学生教育全方位、多层次的人才培养体系。

目前学校拥有国家特色专业建设点4个、国家级教学团队1个、国家级人才培养创新实验区1个、国家级实验教学示范中心1个、国家级精品课程5门、国家双语教学示范课程1门、省重点（建设）专业10个。获有国家级教学成果二等奖2项、省级教学成果奖一等奖5项。在历年全国临床执业医师资格考试中，学校毕业生的成绩在全国百余所设有临床医学类专业的高校中一直处于前10%之内。